授業科目名	特別講義III
時間割番号	LBT447
担当教員名	西野　達哉
開講学期・曜日・時限	集中・(未登録)・(未登録)	単位数	1
＜対象学生＞
生命工学科3年次生以上
＜授業の目的＞
生命工学研究の最前線「実践 バイオインフォマティクス解析」 近年の生命科学は生体分子の配列解析や構造解析を通じて膨大な情報がデータベースに蓄積されている。生命情報の取り扱いはバイオインフォマティクスと呼ばれ、その重要性は増す一方である。そこで本講義では、講義を通じてタンパク質の配列や立体構造のバイオインフォマティクスを理解する。さらに、PC演習を通じてデータベース利用法や立体構造描画法を身に付けることで、生命科学の理解を深めることを目的とする。
＜本授業科目による獲得・涵養が特に期待されるコンピテンシー＞（能力・資質）
生命環境学部>生命工学科向け 記号 コンピテンシー（能力・資質） 説明   BT-A 専門 実践力 生命工学分野の専門的な知識と技術を応用し、新しいバイオテクノロジーへ活用できる。 ◎ BT-B 共通 教養 様々な学問分野の考え方 当該科目の学問分野(人文･社会･自然･健康科学等)の考え方を説明できる。 ○
＜到達目標＞  到達目標とは
目標NO 説明 コンピテンシーとの対応 BT 1 講義を通じて学んだタンパク質の配列や立体構造のバイオインフォマティクスの基礎を説明できる。 BT-A 2 PC演習を通じてデータベースを利用したり立体構造を描画することができる。 BT-B
＜成績評価の方法＞
目標No 割合 評価の観点 1 50% 授業時の質疑応答、Moodle上での復習課題、レポートにより理解度を評価する。 2 50% 授業時の演習や質疑応答、Moodle上での演習課題、レポートにより理解度・技術定着度を評価する。 合計 100%
＜授業の方法＞
・面接授業により、授業および演習を行う。感染症拡大状況に応じて面接授業とライブ型の併用実施の可能性も有るため、事前の通知を確認すること。 ・事前学習を必須とする。 ・講義内容の理解度を確認するため、逐次、ディスカッションを行う。 ・各演習では課題を出す。 ・講義および演習の双方についてレポートを課す。
＜受講に際して・学生へのメッセージ＞
『近年の生命科学は生体分子の配列解析や構造解析を通じて膨大な情報がデータベースに蓄積されています。生命情報の取り扱いはバイオインフォマティクスと呼ばれ、その重要性は増す一方です。そこで本講義では、講義を通じてタンパク質の配列や立体構造のバイオインフォマティクスを理解することを目的とします。さらに、PC演習を通じてデータベース利用法や立体構造描画法を身に付けることで、生命科学の理解を深めることを目的とします。』そのため、本特別講義では、PC演習を通じて実際に手を動かしてバイオインフォマティクスを学んでいただきます。各自PCを持参してください。
＜テキスト＞
(未登録)
＜参考書＞
見てわかる構造生命科学, 化学同人 初めてののバイオインフォマティクス, 講談社サイエンティフィク いきなり始める構造生物学, 秀潤社
＜授業計画の概要＞
1 タイトル 1. バイオインフォマティクスのイントロダクション 事前学習 事後学習 配布資料に基づいて予習を行う。 授業内容に基づいて復習を行い、理解を深める。 授業内容 バイオインフォマティクスのイントロダクションについて学ぶ。ソフトウエアのインストールと起動テストを行う。 2 タイトル 2. 配列解析 事前学習 事後学習 配布資料に基づいて予習を行う。 授業および演習内容に基づいて復習を行い、理解を深める。 授業内容 配列解析について学ぶ。演習にて相同性検索とマルチプルアラインメントを行う。 3 タイトル 3. タンパク質のドメイン 事前学習 事後学習 配布資料に基づいて予習を行う。 授業および演習内容に基づいて復習を行い、理解を深める。 授業内容 タンパク質のドメインについて学ぶ。演習にて構造バイオインフォマティクスを行う。 4 タイトル 4. アミノ酸配列からの構造予測とデザイン 事前学習 事後学習 配布資料に基づいて予習を行う。 授業および演習内容に基づいて復習を行い、理解を深める。 授業内容 アミノ酸配列からの構造予測とデザインについて学ぶ。演習にてタンパク質二次構造予測を行う。 5 タイトル 5. タンパク質の立体構造 事前学習 事後学習 配布資料に基づいて予習を行う。 授業および演習内容に基づいて復習を行い、理解を深める。 授業内容 タンパク質の立体構造について学ぶ。演習にてタンパク質二次構造予測を行う。 6 タイトル 6. タンパク質や核酸、糖の立体化学 事前学習 事後学習 配布資料に基づいて予習を行う。 授業および演習内容に基づいて復習を行い、理解を深める。 授業内容 タンパク質、核酸、糖の立体化学を学ぶ。演習にて綺麗な立体構造図を作る。 7 タイトル 7. タンパク質の立体構造解析 事前学習 事後学習 配布資料に基づいて予習を行う。 授業および演習内容に基づいて復習を行い、理解を深める。 授業内容 タンパク質の立体構造解析を学ぶ。演習にて異なる立体構造解析法と得られる構造情報の違いを学ぶ。 8 タイトル 8. 総括 事前学習 事後学習 配布資料に基づいて予習を行う。 授業内容、レポート課題に基づいて復習を行い、理解を深める。 授業内容 総括を行う。レポートを作成する。 9 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 10 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 11 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 12 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 13 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 14 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 15 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 16 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 17 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 18 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 19 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 20 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 21 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 22 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 23 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 24 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 25 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 26 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 27 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 28 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 29 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容 30 タイトル 事前学習 事後学習 授業内容
＜実務経験のある教員による授業科目の概要＞
生物分子工学研究所、 ウィーン分子病理学研究所（オーストリア）、オックスフォード大学生化学部（イギリス）、国立遺伝学研究所分子遺伝研究部門での実務に関連して、嬢染色体分配機構に関する細胞構造生物学的研究ついて講義する。
＜備考＞
(未登録)