授業科目名				担当教員
環境生物学特論				河野　哲郎
時間割番号	単位数	コース	履修年次	期別	曜日	時限
324210	2	(未登録)	1	後期	木	IV
［概要と目標］
微生物とりわけ原核生物は、環境の浄化と保全で多大な役割を果たしている。本講では、学部の基礎生物学及び環境生物学で学習したことを基礎とし、演習・実習を交えて生命反応におけるエネルギーの概念、生物顕微鏡の理論と微生物の観察法、及び、遺伝子微生物学での系統と系統解析の３つのトピックについて、実践的な理解を目標とした授業を行う。
[到達目標]
１．生命反応における化学熱力学と化学平衡<BR>２．16S rDNAにもとづいた微生物の系統分類の理解、及び、フリーのバイオインフォマチックス関係のソフトとパブリックのデータベースを用いた微生物の系統解析法の習得
［必要知識・準備］
基礎生物学と環境生物学の単位を取得しているか、あるいは、それに相当する教科の単位を取得していることが必要。この講義は、前半はテキスト（配布する）に基づいて化学熱力学と化学平衡について学習する。後半は16S rRNAを対象として系統解析とプライマーの設計を学習する。講義は、前半はSUPCRT92とVisualMINTEQ、後半はAnnHyb、MEGA5、GeneDoc、ｊPCR、Primer-BLAST、RDPIIなどのソフト・データベースを用いた演習形式で行う
［評価基準］
No 評価項目 割合 評価の観点 1 小テスト／レポート  20  % 課題演習のレポート及び実習のレポートの内容  2 受講態度  60  % 出席状況（15%）、質問状況（15%）  3 発表／表現等  20  % 課題演習の発表内容、実習の発表内容
［教科書］
講義テキスト（水環境の化学熱力学基礎）は配布する。
［参考書］
(未登録)
［講義項目］
＜前半＞<BR>１．生命活動の熱力学１：熱力学第1法則（エンタルピー）<BR>２．生命活動の熱力学２：熱力学第2法則（エントロピー）<BR>３．生命活動の熱力学３：熱力学第1＋第2：Gibbsの自由エネルギー<BR>４．生命活動の熱力学４：化学平衡<BR>＜後半＞<BR>５．原核生物の系統と系統解析１：講義<BR>６. 原核生物の系統と系統解析２：Bioinfomatics関係のソフトの使用法の演習<BR>７．原核生物の系統と系統解析３：パブリックのデータベースの使用法の演習<BR>８．原核生物の系統と系統解析４：系統解析<BR>９．原核生物の系統と系統解析５：特異的プライマーセットの設計